Fehlregulationsschmerzen beruhen auf einer unangemessenen Funktion eines physiologischen oder biochemischen Regulationssystems, z.B. unangepasste motorische Steuerung der Skelettmuskulatur (Hartspann, Schmerzen bei Fehlhaltung), Fehlfunktion des sympathischen Nervensystems (sympathische Reflexdystonie, Ischämie durch Vasospasmus), Fehlregulation von Neurotransmitterwirkungen auf die Gehirngefäße (Migräne), u.a.